本周分享文献：PopulationprevalenceandinheritancepatternofrecurrentCNVsassociatedwithneurodevelopmentaldisordersin12,newbornsandtheirparents，于年8月4日发表在EuropeanJournalofHumanGenetics(IF=3.)上。现小编就带大家一起来揭开这篇文章的面纱。
拷贝数变异(Copynumbervariations，CNVs)是神经发育障碍(Neurodevelopmentaldisorders，NDD)常见的致病原因，与一系列神经发育特征相关。复发性CNVs(RecurrentCNVs)发生在特定的、容易发生缺失重复的基因组区域，并且常常具有高度临床异质性和不完全外显的特点。本文将把这种CNVs称为与神经发育障碍相关的复发性CNVs(NDDCNVs)。目前的研究缺乏对NDDCNVs的人群流行率和遗传模式的可靠估计。
本研究中，我们使用芯片平台对来自挪威的12,个trio家系开展了母亲-父亲-儿童队列研究(MoBa)，详细分析了13个基因组区域、26个复发性NDDCNVs的遗传模式，更清楚地了解与神经发育延迟有关的复发性微缺失/微重复流行率，并为遗传诊断和咨询提供依据。
本研究是一项基于人群的妊娠队列研究，由挪威公共卫生研究所开展。该研究所从年至年从挪威各地招募孕妇，从而获得trios家系的DNA数据，然后使用HumanCoreExome12V.1.1、HumanCoreExome-24V.1.0、Illumina’sGlobalScreeningArrayv.1.0芯片对DNA数据进行基因分型，综合分析了与神经发育疾病相关的复发性拷贝数缺失和重复的流行率、遗传模式和新发突变发生率等内容。
研究的基因组区域
◆本研究调查了与NDD相关的已知染色体区域，包括1q21.1、3q29、7q11.23、15q11.2–13.1、15q13.3、16p11.2远端和近端、17p13.3、17p11.2、17q12、17q21.31和22q11.2远端和近端(如图)。
详见原文Figure1：从MoBa队列中鉴定的复发性NDDCNVs
NDDCNVs的类型
◆在trio家系后代中观察到59个复发性NDDCNVs。
◆在59个复发性NDDCNVs中，39个遗传自父母，20个是新发突变；25个NDDCNVs为缺失(deletions，del)，34个NDDCNVs为重复(duplications，dup)。
◆与拷贝数重复相比，拷贝数缺失的比例(12个缺失vs27个重复，p=0.)在遗传性CNV中较低(因为dup的相对表型更温和)，而在新发突变中具有相反趋势(13个denovo缺失vs7个denovo重复，p=0.18)，见表。
详见原文Table1：复发性NDDCNVs的类型及其累计流行率估计值
NDDCNVs的亲本来源
◆在遗传性CNV中，母系NDDCNVs的比例更高(24个来自母本vs15个来自父本)。
◆在新发突变中，复发性NDDCNVs的发生数量在母本染色体(10个)和父本染色体(9个)中无显著差异。
详见原文Figure2：MoBa队列中复发性NDDCNVs的
亲本来源
NDDCNVs的流行率
◆性NDDCNVs的总流行率估计值为0.48%(95%CI：0.37%，0.62%)。
◆母亲(0.35%，43例)与父亲(0.36%，44例)中NDDCNVs的总体流行率相似，且低于子代的总体流行率(0.48%，59例)。
◆特定基因组区域(1q21.1、3q29、7q11.23、15q11.2、15q13.3、16p11.2、17p11.2、17p13.3、17q12、17q21.31和22q11.2)的NDDCNVs流行率，见表2。
详见原文Table2：13个基因组区域中与神经发育障碍相关的复发性NDDCNVs的流行率估计
①活产儿中复发性NDDCNVs的总流行率为0.48%(95%CI:0.37-0.62%)，即1/的新生儿在这些NDDs相关区域有缺失或重复。
②约1/3新生儿的NDDCNVs(34%，N=20/59)是新发突变。
③本研究仔细评估了26例NDDCNVs的流行率和遗传信息，发现以下几种CNVs的流行率比以往报道的要高：1q1.1del(~1:0)、15q11.2dup(~1:)、15q13.3del(~1:)；以下几种CNVs的流行率比之前报道的要低：16p11.2del(~1:0)、17q12del(~1:)，22q11.2del(~1:10)。
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