检查的目的在于区别便秘，是由器质性肠梗阻引起还是由功能性问题引起。检查项目应随年龄不同而不同。
急性梗阻
检查
原理
全血细胞计数
主要作为术前评估常规
尿素氮和电解质
在肠梗阻中会有电解质异常，应加以评估。这些指标有助于评价患儿是否有脱水
腹部X线片
对肠梗阻诊断非常有帮助，典型病例可以发现扩张的肠段伴有液平
腹部超声
可以诊断一些疾病，例如学龄前儿童的肠套叠
造影检查
在新生儿中可以确定肠闭锁的部位，或可以诊断肠旋转不良，后者发生肠扭转的可能性很大。造影检查在胎粪性肠梗阻中具有治疗作用，可以冲走滞留的胎粪
空气灌肠
特别应用在怀疑有肠套叠的病人中，不但可以明确诊断，而且在部分病例中还有治疗作用
直肠活检
是诊断先天性巨结肠的金标准
功能性（非器质性）
当病史和体格检查支持功能性便秘诊断时，许多病人就不需要任何检查了。对于那些对积极治疗无效或有其他异常表现的患者，需要考虑进一步检查。
检查
原理
血清钙和甲状腺功能
高钙血症和甲状腺功能减退可导致便秘，但都会伴随其他异常表现
腹部X线片
往往不需要拍摄X线来明确诊断，但是X线可以用来向家长说明孩子确实有便秘。儿童表现腹泻时，家长可能特别难以接受这种诊断和泻药治疗
直肠活检
是诊断先天性巨结肠的金标准，在患儿治疗效果很差时应该要考虑
测压法
医院中应用，这项技术可以用来诊断低位肠道功能是否正常
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